Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcbp3P57722 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms