Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1P55194 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1P55194 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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