Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna7P49582 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms