Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 KAP114YGL241W 3015 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 OCA4YCR095C 1089 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 ALB1YJL122W 528 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 MVD1YNR043W 1191 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 TAF3YPL011C 1062 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 snR189snR189 189 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 REI1YBR267W 1182 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 WTM2YOR229W 1404 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 PCA1YBR295W 3651 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 PBI1YPL272C 1554 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 YCR015CYCR015C 954 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 HOT13YKL084W 351 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 YKL177WYKL177W 339 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 YAR023CYAR023C 540 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 YOR062CYOR062C 807 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 RGS2YOR107W 930 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 TIF5YPR041W 1218 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 SHE3YBR130C 1278 nt5.05□□□□□ -1.6
VID28P40547 KTR7YIL085C 1554 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 ERG25YGR060W 930 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 GPP1YIL053W 753 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 UPS2YLR168C 693 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 REX4YOL080C 870 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 YOR097CYOR097C 528 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 Q0255Q0255 1419 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 DBP5YOR046C 1449 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 RAD16YBR114W 2373 nt5.04□□□□□ -1.6
VID28P40547 YBR139WYBR139W 1527 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 FLO8YER109C 2400 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 PER1YCR044C 1074 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 PLP1YDR183W 693 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 BMH1YER177W 804 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 RNA15YGL044C 891 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 AAD10YJR155W 867 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 YAL066WYAL066W 309 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 CSR1YLR380W 1227 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 ERD2YBL040C 660 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 YNL171CYNL171C 369 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 THI80YOR143C 960 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 APA1YCL050C 966 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 MAK11YKL021C 1407 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 SFI1YLL003W 2841 nt5.03□□□□□ -1.6
VID28P40547 MET4YNL103W 2019 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 NUP2YLR335W 2163 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 YPS7YDR349C 1791 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 PXR1YGR280C 816 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 HIS6YIL020C 786 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 LOH1YJL038C 660 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 YPL278CYPL278C 303 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 MRP2YPR166C 348 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 YIL001WYIL001W 1542 nt5.02□□□□□ -1.61
VID28P40547 SUM1YDR310C 3189 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 MDR1YGR100W 2853 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 SSH4YKL124W 1740 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 CTH1YDR151C 978 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 LYS5YGL154C 819 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 GAB1YLR459W 1185 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 YNL057WYNL057W 333 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 EAF7YNL136W 1278 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 LYP1YNL268W 1836 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 CTT1YGR088W 1689 nt5.01□□□□□ -1.61
VID28P40547 ARN1YHL040C 1884 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 SER3YER081W 1410 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 snR7-SsnR7-S 179 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 TRM8YDL201W 861 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 SUR2YDR297W 1050 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 POL32YJR043C 1053 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 YJR071WYJR071W 369 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 SHE1YBL031W 1017 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 SPS19YNL202W 879 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 CUS2YNL286W 858 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 YNL303WYNL303W 348 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 YOR114WYOR114W 885 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 YBR013CYBR013C 390 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 GRE1YPL223C 507 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 YBR292CYBR292C 372 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 RER1YCL001W 567 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 ADP1YCR011C 3150 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 PRM7YDL039C 2097 nt5□□□□□ -1.61
VID28P40547 YCR100CYCR100C 951 nt4.99□□□□□ -1.61
VID28P40547 YDR056CYDR056C 618 nt4.99□□□□□ -1.61
VID28P40547 BUD13YGL174W 801 nt4.99□□□□□ -1.61
VID28P40547 YHR054CYHR054C 1065 nt4.99□□□□□ -1.61
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