Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddit3P35639 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddit3P35639 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms