Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd22P35329 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd22P35329 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd22P35329 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd22P35329 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd22P35329 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms