Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms