Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Oprk1P33534 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Oprk1P33534 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.5 ms