Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa2P31245 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms