Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apex1P28352 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apex1P28352 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms