Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntf3P20181 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntf3P20181 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms