Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCAM1P19320 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms