Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRFP11831 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRFP11831 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRFP11831 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRFP11831 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRFP11831 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRFP11831 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRFP11831 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRFP11831 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFP11831 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFP11831 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFP11831 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRFP11831 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRFP11831 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRFP11831 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRFP11831 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRFP11831 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRFP11831 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRFP11831 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRFP11831 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRFP11831 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRFP11831 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRFP11831 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms