Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Prm2P07978 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Prm2P07978 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms