Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06323 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06323 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06323 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06323 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06323 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06323 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06323 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06323 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P06323 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06323 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06323 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06323 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06323 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06323 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06323 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06323 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms