Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt1P04104 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt1P04104 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms