Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtatp6P00848 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms