Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb3O35393 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb3O35393 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb3O35393 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms