Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gm19965J3QNY8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm19965J3QNY8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Gm19965J3QNY8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Gm19965J3QNY8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Gm19965J3QNY8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm19965J3QNY8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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