Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6176J3QK59 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6176J3QK59 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6176J3QK59 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms