Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim15G3UY57 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms