Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BC005561E9Q5E2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms