Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Zfp558E9Q1J0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Zfp558E9Q1J0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Zfp558E9Q1J0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Zfp558E9Q1J0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Zfp558E9Q1J0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Zfp558E9Q1J0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Zfp558E9Q1J0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Zfp558E9Q1J0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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