Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfta2E9PXB6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms