Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms