Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms