Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF27A3QJZ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms