Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms