Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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