Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb4A2A863 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb4A2A863 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms