Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPA9

Scgb2b18, ABPBG18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b18A0A087WPA9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scgb2b18A0A087WPA9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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Scgb2b18A0A087WPA9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scgb2b18A0A087WPA9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Scgb2b18A0A087WPA9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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