Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z199

Supt4h1b, Transcription elongation factor SPT4-B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1bQ9Z199 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Supt4h1bQ9Z199 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Supt4h1bQ9Z199 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms