Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms