Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
S1pr4Q9Z0L1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1pr4Q9Z0L1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1pr4Q9Z0L1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms