Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slit3Q9WVB4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit3Q9WVB4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit3Q9WVB4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit3Q9WVB4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit3Q9WVB4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit3Q9WVB4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slit3Q9WVB4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms