Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN2Q9ULH4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN2Q9ULH4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1306.4 ms