Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psma1Q9R1P4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms