Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms