Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRMS1Q9HCU9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms