Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r48Q9EQ52 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r48Q9EQ52 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms