Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aph1cQ9DCZ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms