Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmuQ9DAT5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms