Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx5Q9D8U8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms