Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms