Protein–RNA interactions for Protein: Q9D807

2200002J24Rik, RIKEN cDNA 2200002J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002J24RikQ9D807 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2200002J24RikQ9D807 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2200002J24RikQ9D807 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms