Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ribc2Q9D4Q1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Ribc2Q9D4Q1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ribc2Q9D4Q1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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