Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2lQ9D478 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Odf2lQ9D478 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2lQ9D478 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms