Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2bQ9D1Y9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms