Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms