Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1F3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D1F3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D1F3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D1F3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D1F3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1F3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1F3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1F3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms